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Dr Daniel FONCEKA

Chargé de recherche, coordonnateur scientifique du CERAAS

Domaine d’expertise

  • Génétique moléculaire
  • Sélection assistée par marqueurs

Cheminement académique

  • Chercheur CIRAD, affecté au CERAAS depuis Aout 2012
  • Phd Génétique moléculaire, Université Montpellier Supagro 2010
  • Master, productions végétales, Université Denis Diderot Paris VII, 2003

Lien d’intérêt : exemple page personnelle

Unité de recherche :
Unité Mixte de Recherche Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP – Montpellier)

Projet de recherche en cours
Elargissement de la base génétique de l’arachide par croisements interspécifiques : Développement de populations et identification d’allèles nouveaux utilisables en sélection. 2013 – 2017. Budget : $232000
Comprehensive characterization of the wild introgression in the peanut chromosome segment substitution lines (CSSL) population : whole genome sequencing and new markers discovery. 2014 – 2016. Budget : $101200
Genomic approaches to capture novel alleles in cultivated peanut to increase smallholder production. 2016 – 2019. Budget : $384595

Partenaires (organismes, entreprises)
SMIL, KSU, University of Georgia, North Carolina State University, ICRISAT, EMBRAPA IER, INERA, INRAN, UCAD, ENSA

Publications (5 dernières années)
Tovignan K.T., Luquet D., Fonceka D., Ndoye I., Trouche G., Cisse N. 2015 Assessment of the variability of Senegalese landraces for phenology and sugar yield components to broaden the genetic pool of multi-purpose sorghum. Plant Genetic Resources, 11 p. http://dx.doi.org/10.1017/S1479262115000155

Tovignan K.T., Fonceka D., Ndoye I., Cissé N., Luquet D. 2015. The benefit of green leaf area dynamics in photoperiodic sorghum depend on sowing date and post-flowering water status. Field Crop Research (accepted minor revision)

Lacape J.M., Loison R., Fonceka D. 2016 Enhanced drought adaptation in african savanna crops. In : Climate change and agriculture worldwide. Torquebiau Emmanuel (ed.), Manley, David (trad.), Cowan, Paul (trad.). Heidelberg : Springer, 59-71. ISBN 978-94-017-7460-4 http://dx.doi.org/10.1007/978-94-017-7462-8_5
Komivi Dossa 1,2, Xin Wei 1, Yanxin Zhang 1, Daniel Fonceka 2,3, Wenjuan Yang 1, Diaga Diouf 4, Boshou Liao 1, Ndiaga Cissé 2,* and Xiurong Zhang 1,* (2016) Analysis of Genetic Diversity and Population Structure of Sesame Accessions from Africa and Asia as Major Centres of Its Cultivation. Genes, In-press
Zossou N., Hurbert Adoukonou S., Fonceka D., Lamine B.M., Sall M.N., Adam A., and Sinsin B. (2016) Genetic diversity of Rhamphicarpa fistulosa populations in rainfed lowland rice in West-Africa. Weed Science, In-Press.

Rami J.F., Leal-Bertioli S.C.M., Fonceka D., Moretzsohn M.C. and Bertioli D.J. 2014. Alien gene transfer in crop plants : groundnut. A. Pratap and J. Kumar (eds.), Alien gene transfer in crop plants, Volume 2 : Achievements and Impacts, DOI 10.1007/978-1-4614-9572-7_12

K. Shirasawa, D. J. Bertioli, R. K. Varshney, M. C. Moretzsohn S. C. M. Leal-Bertioli M. Thudi, M. K. Pandey, J-F Rami, D. Fonceka, M. V. C. Gowda, H Qin,, BAOZHU Guo, Y. Hong, X. Liang, H. Hirakawa, S. Tabata, and S. Isobe 2013. Integrated Consensus map of cultivated peanut and wild relatives reveals structure of A and B genomes od Arachis and divergence of the legume genomes. DNA Research, P :1-12 doi:10.1093/ dnares/ dss042

Fonceka D, Hodo-Abalo T, Rivallan R, Vignes H, Lacut E, de Bellis F, Faye I, Ndoye O, Leal-Bertioli SCM, Valls JFM, Bertioli DJ, Glaszmann JC, Courtois B, Rami JF (2012) Construction of Chromosome Segment Substitution Lines in peanut (Arachis hypogaea L.) using a wild synthetic and QTL mapping for plant morphology. PLoS ONE 7(11) : e48642. doi:10.1371/journal.pone.0048642

Gautami B, Fonceka D, Pandey MK, Moretzsohn MC, Sujay V, et al. (2012) An International Reference Consensus Genetic Map with 897 Marker Loci Based on 11 Mapping Populations for Tetraploid Groundnut (Arachis hypogaea L.). PLoS ONE 7(7) : e41213. doi:10.1371/journal.pone.0041213
Fonceka D., T. Hodo-Abalo, R. Rivallan, H. Vignes, I. Faye, O. Ndoye, D. Bertioli, MC. Moretzsohn, JC. Glaszmann, B. Courtois, JF. Rami (2012). Fostered and left-behind alleles in peanut (Arachis hypogaea L.) : Interspecific QTL mapping reveals footprints of domestication and useful natural variation for breeding. BMC Plant Biology 12:1

Billot, C., Rivallan, R., Ndoye Sall, M., Fonceka, D., Deu, M., Glaszmann, J.C., Noyer, J.L., Rami, J.F., Risterucci, A.M., Wincker, P. et al. (2012) A reference microsatellite kit to assess for genetic diversity of Sorghum bicolor (Poaceae). American Journal of Botany, 99, e245-e250.