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Adaptation et optimisation de techniques d’extraction d’ADN sur les céréales sèches (mil, mais, fonio, sorgho) pour l’Afrique de l’Ouest

Mémoire de Master II présenté et soutenu le 3 Août 2012 par Aïssatou SAMBOU à l’UCAD, Département de Biologie Végétale

Résumé : Au Sénégal, à l’apanage de l’ensemble des pays de l’Afrique de l’ouest, l’utilisation des outils moléculaires est généralement limitée par le coût élevé qu’ils nécessitent. C’est ainsi que la mise au point de techniques d’analyse simples et peu coûteuses revêt une grande importance. Dans cette optique, le CERAAS, en tant que centre national de spécialisation du waapp, comporte dans son mandat, la mise au point de techniques d’extraction d’ADN appropriées sur les céréales sèches (Sorghum bicolor, Pennesitum glaucum, Digitaria exelis et Zea mays). Les méthodes d’extraction d’ADN utilisant les tampons MATAB (Mixed Alkyl Trimethyl Ammonium Bromide) ou CTAB (Cetyl trimethylammonium) ont été testées sur feuilles fraîches et séchées de sorgho, mil, fonio et maïs. Les résultats ont porté sur la quantité et la qualité de l’ADN selon la technique utilisée (MATAB et CTAB), le type de feuilles (fraîches et séchées) et selon l’espèce étudiée. Les résultats ont montré que la technique MATAB, appliquée sur feuilles séchées donne les meilleurs rendements d’ADN sur le mil, le fonio et le sorgho. Néanmoins, sur le maïs, c’est la technique CTAB appliquée sur feuilles séchées qui a donné les meilleurs rendements d’ADN. Quelque soit la technique et l’espèce étudiée, les rendements d’ADN sont meilleurs sur feuilles séchées. En conclusion, il apparaît que pour l’ensemble des espèces de céréales de cette étude à l’exception du maïs, la technique MATAB est meilleure pour l’extraction de l’ADN génomique.

Mots-clés : Sorghum bicolor, Pennesitum glaucum, Digitaria exelis, Zea mays, extraction d’ADN génomique, technique MATAB, technique CTAB, Afrique de l’ouest